细菌性肠胃炎
藉由腹泻才可排出细菌。
细菌性肠胃炎主要由细菌感染造成，包括金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、伤寒杆菌及沙门氏菌等。临床上最常见到的是沙门氏菌。至于金黄色葡萄球菌造成的肠胃炎，由于此菌较急性，约4个钟头就会出现症状，通常会在严重食物中毒的情况见到。
至于细菌性肠胃炎的主要症状除了上吐下泻，腹痛范围亦比较集中，不像病毒性肠胃炎会包括大肠、小肠都疼痛。而排泄物会带有黏液或血液、有腐败味，亦可能带点绿色等。
传染途径：粪口传染
造成原因可能是食物不洁；另外，人体的皮肤表面也存有金黄色葡萄球菌，如果手部、指甲没清洁干净，也会因此污染食物，造成严重食物中毒。
治疗方式
通常会视情况给予抗生素治疗，如果3天内状况仍未改善，且有发高烧、呕吐、或腹泻情形，必须立刻就医。细菌性肠胃炎严重情况可能导致肠穿孔、腹膜炎，甚至毒性巨结肠症；临床上还曾遇过进展到全身性感染，像脑膜炎，骨髓炎等情形。
止泻药效果太强，肠子无法蠕动
因此，用药时所开立的止泻药不能太强，如果止泻效果太强，不仅造成肠子无法蠕动、细菌继续孳生，还会严重胀气，甚至导致肠子变薄。所以用药原则是，不会让患者腹泻到脱水的程度，但也不让他完全都不拉肚子。
病毒性肠胃炎
病毒性肠胃炎主要由病毒感染造成，常见为轮状病毒、诺罗病毒等，虽然秋冬的感染情况较多，但夏季仍是会发生。在临床上的症状为呕吐、发高烧、解水便，且排泄物不带有黏液等。另外，腹痛的范围较广，包括大肠、小肠都会疼痛。
潜伏期约为1～3天，如果病毒量较少，潜伏期可能会到一个星期。其它病毒性肠胃炎，也会产生厉害的呕吐、发烧、以及腹痛。
传染途径：以粪口传染为主，不过，有些病毒性肠胃炎会经由飞传染沫。
治疗方式
使用支持性疗法以改善症状，如果腹泻、呕吐严重，可补充电解质水。特别是轮状病毒感染，典型症状是先吐再拉，合并食欲不佳，甚至连水都无法饮用，严重会导致脱水。因此倘若症状仍未缓解，建议住院治疗。